L'université de Montpellier recrute un ou une doctorant(e) pour travailler sur la paléogénomique de la vigne et de l'olivier. Cette thèse s'inscrit dans le cadre du projet de recherche, financé par l'ANR, MICA “Modelling Interactions between Climate change and Agriculture in the ancient West”. Le/la doctorant(e) sera encadré par des experts reconnus dans leurs disciplines respectives pour entreprendre une recherche innovante dans le domaine encore peu exploré de la paléogénomique des plantes. La vigne et l'olivier sont des plantes emblématiques cultivées depuis des milliers d'années dans le Bassin méditerranéen. Les origines de leur domestication sont encore très débattues et la diversité génétique associée à leur domestication, diffusion et diversification variétale demeure mal connue. Le but principal du projet de thèse est de reconstruire des génomes complets de vignes et d'oliviers par l'utilisation de méthodes de séquençage à haut débit, séquençage de génomes complets et de techniques d'enrichissement. Le projet vise à explorer la variabilité spatio-temporelle des génomes et de la structure des populations de graines/fruits de vigne et d'olivier en relation avec les changements climatiques. Les analyses reposeront sur les techniques génomiques et paléogénomiques les plus récentes afin de séquencer de l'ADN ancien à partir de graines de vigne et d'endocarpes d'olives conservés par imbibition dans des contextes archéologiques de Méditerranée et Europe occidentales, datés de 4000 à 1000 avant le présent. Le projet s'attachera à caractériser l'évolution de gènes liés à l'adaptation des plantes aux conditions climatiques (phénologie, résistance au stress hydrique).
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